Read-only file systemで変更できない
root権限でchmodなどを入力しても「Read-only file system」と表示されて変更ができない場合、
mount -o rw,remount /dev/block/mtdblock3 /system
と入力すると、変更できるようになります(上記は、/system での例)。
# 2011/10/13追記
adb remount
これでもいいみたいですね。
※2012/5/6 追記 remountは使える環境(機種)と使えない環境があるみたいです。
参考URL
http://www.adakoda.com/adakoda/2009/03/android-read-only-file-system.html